Иван Капитанов е роден на 29 юли 1977 г. Придобива висшето си образование в УНСС с магистърска степен по специалност „Икономика на индустрията” през 2005 г. До момента е заемал длъжността държавен експерт в дирекция "Финанси на реалния сектор" към Министерство на финансите, където работи от 2002 г.
С решение на УС на ДФ „Земеделие” от 31.03. 2011 г. е назначен за зам. – изпълнителен директор на институцията, с ресор „Държавни помощи, пазарни селскостопански механизми, програма САПАРД и програма Рибарство и аквакултури”. Владее английски език.